Diagnóstico directo de enfermedades infecciosas. Detección de microorganismos en los tejidos afectados.

Diagnóstico de enfermedades autoinmunes: detección de depósitos de anticuerpos o complejos inmunes en los tejidos afectados.

Diagnóstico de neoplasias: detección de marcadores tumorales específicos en las células neoplásicas.

Investigación: por ejemplo, utilizando marcadores leucocitarios (CD “Cluster of diferentiation”) a fin de determinar poblaciones leucocitarias predominantes en ciertas afecciones o tejidos.